MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium sp. KMS chromosome

Total Repeats: 156112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008705	GAT	2	6	15	20	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008705	GTG	2	6	61	66	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008705	TCG	2	6	106	111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866058
4	NC_008705	TCA	2	6	115	120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119866058
5	NC_008705	TCG	2	6	141	146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866058
6	NC_008705	CGA	3	9	160	168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866058
7	NC_008705	CGG	2	6	281	286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866058
8	NC_008705	GGC	2	6	287	292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866058
9	NC_008705	CCT	2	6	322	327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119866058
10	NC_008705	CG	3	6	332	337	0 %	0 %	50 %	50 %	119866058
11	NC_008705	CGA	2	6	355	360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866058
12	NC_008705	GCGG	2	8	362	369	0 %	0 %	75 %	25 %	119866058
13	NC_008705	CTC	2	6	374	379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119866058
14	NC_008705	AGC	2	6	408	413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866058
15	NC_008705	GC	3	6	412	417	0 %	0 %	50 %	50 %	119866058
16	NC_008705	CGG	2	6	427	432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866058
17	NC_008705	CGG	2	6	442	447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866058
18	NC_008705	CGACG	2	10	448	457	20 %	0 %	40 %	40 %	119866058
19	NC_008705	GCA	2	6	478	483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866058
20	NC_008705	CG	3	6	525	530	0 %	0 %	50 %	50 %	119866058
21	NC_008705	TCG	2	6	537	542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866058
22	NC_008705	TCG	2	6	558	563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866058
23	NC_008705	AGC	2	6	564	569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866058
24	NC_008705	GGC	2	6	578	583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866058
25	NC_008705	CCT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119866058
26	NC_008705	CAG	2	6	626	631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866058
27	NC_008705	GCA	2	6	640	645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866058
28	NC_008705	GTC	2	6	650	655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866058
29	NC_008705	CCT	2	6	697	702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119866058
30	NC_008705	GC	3	6	769	774	0 %	0 %	50 %	50 %	119866058
31	NC_008705	GATC	2	8	889	896	25 %	25 %	25 %	25 %	119866058
32	NC_008705	GCGG	2	8	924	931	0 %	0 %	75 %	25 %	119866058
33	NC_008705	GCC	2	6	933	938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866058
34	NC_008705	TCGG	2	8	1017	1024	0 %	25 %	50 %	25 %	119866058
35	NC_008705	AGGCC	2	10	1042	1051	20 %	0 %	40 %	40 %	119866058
36	NC_008705	TC	3	6	1096	1101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008705	G	6	6	1138	1143	0 %	0 %	100 %	0 %	119866059
38	NC_008705	GC	4	8	1297	1304	0 %	0 %	50 %	50 %	119866059
39	NC_008705	CGT	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866059
40	NC_008705	GTA	2	6	1445	1450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119866059
41	NC_008705	CCA	2	6	1486	1491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119866059
42	NC_008705	GAG	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119866059
43	NC_008705	CGCT	2	8	1665	1672	0 %	25 %	25 %	50 %	119866059
44	NC_008705	CCT	2	6	1693	1698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119866059
45	NC_008705	GCG	3	9	1833	1841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866059
46	NC_008705	CGG	2	6	1849	1854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866059
47	NC_008705	TCG	2	6	1855	1860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866059
48	NC_008705	CCG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866059
49	NC_008705	GCA	2	6	1945	1950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866059
50	NC_008705	CCGC	2	8	1957	1964	0 %	0 %	25 %	75 %	119866059
51	NC_008705	CGGC	2	8	2026	2033	0 %	0 %	50 %	50 %	119866059
52	NC_008705	GCC	2	6	2145	2150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866060
53	NC_008705	CG	3	6	2170	2175	0 %	0 %	50 %	50 %	119866060
54	NC_008705	GGCG	2	8	2194	2201	0 %	0 %	75 %	25 %	119866060
55	NC_008705	GAA	2	6	2334	2339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119866060
56	NC_008705	CGAG	2	8	2367	2374	25 %	0 %	50 %	25 %	119866060
57	NC_008705	CG	4	8	2380	2387	0 %	0 %	50 %	50 %	119866060
58	NC_008705	CAC	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119866060
59	NC_008705	ACG	2	6	2416	2421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866060
60	NC_008705	CCG	2	6	2424	2429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866060
61	NC_008705	ACG	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866060
62	NC_008705	ACC	2	6	2480	2485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119866060
63	NC_008705	GCA	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866060
64	NC_008705	CGG	2	6	2706	2711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866060
65	NC_008705	CGG	2	6	2769	2774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866060
66	NC_008705	CGG	2	6	2820	2825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008705	CTCGCT	2	12	2902	2913	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119866061
68	NC_008705	CCG	2	6	2928	2933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866061
69	NC_008705	CGT	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866061
70	NC_008705	GC	3	6	3013	3018	0 %	0 %	50 %	50 %	119866061
71	NC_008705	TCG	2	6	3044	3049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866061
72	NC_008705	CGGCGC	2	12	3053	3064	0 %	0 %	50 %	50 %	119866061
73	NC_008705	TCT	2	6	3105	3110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119866061
74	NC_008705	CCA	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119866061
75	NC_008705	GGTC	2	8	3183	3190	0 %	25 %	50 %	25 %	119866061
76	NC_008705	CCG	2	6	3191	3196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866061
77	NC_008705	CTC	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119866061
78	NC_008705	CCA	2	6	3306	3311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119866061
79	NC_008705	GTC	2	6	3325	3330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866061
80	NC_008705	GCC	2	6	3514	3519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866062
81	NC_008705	CGC	2	6	3537	3542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866062
82	NC_008705	GCC	2	6	3553	3558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866062
83	NC_008705	TCG	2	6	3559	3564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866062
84	NC_008705	CGG	2	6	3569	3574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866062
85	NC_008705	GCC	2	6	3616	3621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866062
86	NC_008705	GCTTGG	2	12	3641	3652	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119866062
87	NC_008705	CGCGG	2	10	3672	3681	0 %	0 %	60 %	40 %	119866062
88	NC_008705	CTT	2	6	3699	3704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119866062
89	NC_008705	CTT	2	6	3710	3715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119866062
90	NC_008705	TGC	2	6	3742	3747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866062
91	NC_008705	TGT	2	6	3764	3769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119866062
92	NC_008705	CCG	2	6	3811	3816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866062
93	NC_008705	ACC	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119866062
94	NC_008705	TCA	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119866062
95	NC_008705	CAG	2	6	3945	3950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866062
96	NC_008705	CGA	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866062
97	NC_008705	CCA	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119866062
98	NC_008705	TGC	2	6	4015	4020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866062
99	NC_008705	ATC	2	6	4024	4029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119866062
100	NC_008705	GCG	2	6	4040	4045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866062
101	NC_008705	GTCG	2	8	4080	4087	0 %	25 %	50 %	25 %	119866062
102	NC_008705	TCC	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119866062
103	NC_008705	GCCG	2	8	4139	4146	0 %	0 %	50 %	50 %	119866062
104	NC_008705	GGCA	2	8	4222	4229	25 %	0 %	50 %	25 %	119866062
105	NC_008705	CTT	2	6	4308	4313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119866062
106	NC_008705	GTG	2	6	4357	4362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119866062
107	NC_008705	CG	3	6	4395	4400	0 %	0 %	50 %	50 %	119866062
108	NC_008705	GAA	2	6	4440	4445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119866062
109	NC_008705	GAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119866062
110	NC_008705	GAT	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119866062
111	NC_008705	CGG	2	6	4566	4571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866063
112	NC_008705	GCG	2	6	4599	4604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866063
113	NC_008705	CGC	2	6	4609	4614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866063
114	NC_008705	TCC	2	6	4642	4647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119866063
115	NC_008705	CCG	2	6	4694	4699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866063
116	NC_008705	ACG	2	6	4764	4769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866063
117	NC_008705	CGGAG	2	10	4775	4784	20 %	0 %	60 %	20 %	119866063
118	NC_008705	CGT	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866063
119	NC_008705	CG	3	6	4877	4882	0 %	0 %	50 %	50 %	119866064
120	NC_008705	TGG	2	6	4915	4920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119866064
121	NC_008705	TCG	2	6	4990	4995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866064
122	NC_008705	ACG	2	6	5044	5049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866064
123	NC_008705	ACCG	2	8	5055	5062	25 %	0 %	25 %	50 %	119866064
124	NC_008705	CCA	3	9	5069	5077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119866064
125	NC_008705	TCG	2	6	5101	5106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866064
126	NC_008705	GCA	2	6	5123	5128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866064
127	NC_008705	ACTG	2	8	5160	5167	25 %	25 %	25 %	25 %	119866064
128	NC_008705	CGG	2	6	5254	5259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866065
129	NC_008705	ACG	3	9	5265	5273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866065
130	NC_008705	CGGC	2	8	5290	5297	0 %	0 %	50 %	50 %	119866065
131	NC_008705	CG	4	8	5332	5339	0 %	0 %	50 %	50 %	119866065
132	NC_008705	CGG	2	6	5341	5346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119866065
133	NC_008705	TTG	2	6	5347	5352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119866065
134	NC_008705	TC	3	6	5387	5392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008705	GTT	2	6	5452	5457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008705	TTC	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008705	CCG	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_008705	TGT	2	6	5654	5659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008705	GA	3	6	5677	5682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008705	GGC	2	6	5720	5725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008705	ACA	2	6	5822	5827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008705	ACG	3	9	5830	5838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_008705	TTCG	2	8	5886	5893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008705	GTC	2	6	5899	5904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_008705	CCGACC	2	12	5942	5953	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	119866066
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258	NC_008705	GTT	2	6	10155	10160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119866069
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263	NC_008705	GTG	2	6	10375	10380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119866069
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267	NC_008705	CGC	3	9	10549	10557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866069
268	NC_008705	CGA	2	6	10563	10568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866069
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271	NC_008705	CGC	2	6	10656	10661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866069
272	NC_008705	CGC	2	6	10725	10730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866069
273	NC_008705	GTT	2	6	10740	10745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119866069
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282	NC_008705	GCC	2	6	11062	11067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866069
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473	NC_008705	GGCG	2	8	17874	17881	0 %	0 %	75 %	25 %	119866072
474	NC_008705	CGA	2	6	17889	17894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119866072
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485	NC_008705	CGAC	2	8	18373	18380	25 %	0 %	25 %	50 %	119866073
486	NC_008705	CGGC	2	8	18381	18388	0 %	0 %	50 %	50 %	119866073
487	NC_008705	GCC	2	6	18411	18416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119866073
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499	NC_008705	TCG	2	6	18694	18699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119866073
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